近年来全球感染性疾病的发病率有所上升,病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势,半数患者存在病原体不明的困境,病原体的快速诊断面临严峻挑战。目前用于临床病原体检测的方法主要包括传统培养法、PCR法、宏基因组测序(mNGS)、病原靶向测序(tNGS)等。新冠核酸检测让荧光PCR技术大放异彩,新冠之后mNGS因抗疫扬名,一度被临床医生所青睐,逐步走向寻常百姓家。tNGS靶向测序技术更是异军突起,以其对“PCR”和“NGS”兼容并蓄的优势和快速、精准、高性价比的测序服务,在临床检验领域正受到越来越多的关注和使用。
表1.病原体检测方法比较
类别 |
培养法 |
PCR 法 (荧光法或熔曲法) |
mNGS |
tNGS(扩增子富集) |
tNGS(靶向捕获) |
可检测病原体 |
1 种/1 类 |
1 种-数十种 |
2 万多种 |
数十种-数千种 |
数十种-数千种 |
优势 |
低成本 |
快速 灵敏度高 |
覆盖新发和罕见病原 检测快速、阳性率高 |
灵敏度、特异性高 不受宿主 DNA 影响 |
灵敏度、特异性高 不受宿主 DNA 影响 |
局限性 |
阳性率低 通量低 |
需预设引物 检测数量有限 |
生信分析要求高 操作流程复杂 受宿主 DNA 含量影响 |
检测范围有限 不能检测新发病原 |
捕获探针成本较高 |
检测周期 |
常规 1-4 天 |
数小时 |
24 小时内 |
12 小时内 |
24 小时内 |
(点击可查看大图)
图1 生物制品宿主核酸残留质控产品一览
在病原体检测过程中,污染的背景菌核酸可能会淹没低丰度的靶标核酸或和靶标核酸一起被检出,从而影响靶标检出灵敏度或造成假阳性结果,给医生诊断和用药造成困扰。
在宿主核酸残留质控产品研发生产过程中,分子酶中若存在残留宿主(如人源、鼠源、大肠杆菌、酵母等)核酸,极可能造成宿主核酸残留质控产品定量不准确,从而给生产的生物制品带来安全隐患。
5981cc万洲国际UCF.ME®超低残留分子酶解决方案
ISO认证超洁净分子酶生产基地-UCF.ME
(点击可查看大图)
图2.5981cc万洲国际UCF.ME®超洁净分子酶生产基地
5981cc万洲国际UCF.ME®超低残留分子酶产品
表2.5981cc万洲国际UCF.ME®超低残留分子酶产品清单
产品分类 |
产品名称 |
产品货号 |
Ecoli宿主gDNA质控标准 |
qPCR/RT-qPCR超低残留酶原料 |
Hieff UCF.ME ® Hotstart Sensitive Taq DNA Polymerase |
14314ES |
<0.005 copies/U |
Hifair UCF.ME®V Reverse Transcriptase |
14608ES |
<0.005 copies/U |
|
14672ES |
<0.001 copies/U |
||
14675ES |
<0.001 copies/U |
||
UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase(UDG/UNG),heat-labile,1 U/ μ L |
14466ES |
<0.1 copies/U |
|
UCF.ME® Uracil DNA Glycosylase (UDG/UNG),1 U/μ L |
14454ES |
<0.1 copies/U |
部分数据展示
图3.5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)E.coli基因组DNA残留检测
使用5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)及进口品牌A的Taq DNA聚合酶进行质粒DNA残留检测,结果显示,进口品牌A的Taq DNA聚合酶中存在质粒DNA残留,5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)中无质粒DNA检出。
图4.质粒DNA残留检测结果
使用5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)搭配铜绿假单胞菌,鲍曼不动杆菌,粘质沙雷氏菌,肺炎克雷伯菌,嗜麦芽窄食单胞菌,肺炎链球菌,屎肠球菌,金黄色葡萄球菌,大肠杆菌,粪肠球菌,白色念珠菌特异性引探对NTC(No Template Control)进行检测,结果显示,5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)中无以上11种常见背景菌检出。
图5.11种常见背景菌检测结果(限于篇幅,以铜绿假单胞菌,鲍曼不动杆菌,粘质沙雷氏菌,肺炎克雷伯菌为例进行展示)
客户分别使用市售常规Taq酶和5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)搭配客户E. coli特异性引探对NTC进行检测,结果显示市售常规Taq酶在22次重复实验中出现5次起峰,而5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)在22次重复实验中均未起峰,结果表明5981cc万洲国际UCF.ME® Taq酶(Cat#14314ES)未检出E. coli基因组DNA。
图6:E.coli 基因组DNA残留检测(客户测试案例)
左图:市售常规Taq酶;右图:5981cc万洲国际UCF.ME®Taq酶(Cat#14314ES)
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