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Hieff NGS® C102P4 Mouse ITS/ETS Depletion Probe
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HieffNGS®C102P4MouseITS/ETSDepletionProbe是针对小鼠的45SITS/ETS区域设计的探针,能够有效去除小鼠的 45SITS/ETS区域。该产品搭配HieffNGS®MaxUpHumanrRNADepletionKit(rRNA&ITS/ETS)(Yeasen#12257)使用, 有效去除总RNA中的rRNA及小鼠的45SITS/ETS区域以保留信使RNA(mRNA)和其他非编码RNA。该试剂盒对于完整 和部分降解的总RNA均具有良好的rRNA去除效果。经rRNA&ITS/ETS去除所获得的RNA样本可用于高通量测序分析 mRNA和非编码RNA,可显著提高测序结果中有效数据比例,也可用于cDNA合成或其它下游应用。 适用范围 适用于小鼠血液来源的100ng~1μg总RNA样品;适用于完整或部分降解RNA样品。 产品组分 组分编号和名称13528ES0813528ES2413528ES96 MouseITS/ETSProbe8μL24μL96μL

存储条件

干冰运输,-20°C存放,有效期一年。 注意事项 1.请使用无RNase污染的耗材,并对实验区域定期进行清理,推荐使用ThermoFisher公司的RNAZapTM高效核酸去除喷 雾去除RNA酶污染。 2.RNA样品应不含基因组DNA污染,若样品中有gDNA残留,应先进行DNaseI消化并纯化后再用于本试剂盒。 3.RNA样品最大投入体积为9μL,若样品体积较大,可先进行浓缩。 4.本产品仅用作科研用途! 自备材料 1.RNA纯化磁珠:HieffNGS®Cleaner(Cat#12602)或其他等效产品。 2.qRT-PCR质检rRNA去除效率:Hieff®qPCRSYBRGreenMasterMix(NoRox)(Cat#11201)或其他等效产品; 3.其他材料:无水乙醇、无菌超纯水、低吸附枪头、PCR管、磁力架、PCR仪等。 操作步骤 1.探针杂交 1.1将探针和杂交Buffer从-20°C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。 1.2准备RNA样品:根据投入量和样品浓度,计算RNA取样体积,用NucleasefreeH2O稀释至9μL。 1.3按照表1于200μLPCR管中配制rRNA去除反应体系。 YeasenBiotechnology(Shanghai)Co.,Ltd. Hotline:400-6111-883 E-mail:order@yeasen.com 网址:www.yeasen.com第2页,共4页 表1探针杂交反应体系 名称体积(μL) HybridizationBuffer3 HumanProbeMix(rRNA&ITS/ETS)2 MouseITS/ETSProbe1 TotalRNA9(100ng~1μg) Total15 1.4使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。 1.5将上述PCR管置于PCR仪中,按照表2所示反应程序,进行探针杂交反应。 表2探针杂交反应程序 温度时间 热盖105°COn 95℃2min 95℃-22℃0.1℃/s 22℃5min 4℃hold 2.RNaseH消化 2.1将RNaseH消化试剂从-20°C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表3所示,配制RNaseH消化反应体系。 表3RNaseH消化反应体系 名称体积(μL) RNaseHBuffer3 RNaseH2 上步产物15 Total20 2.2使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。 2.3将上述PCR管置于PCR仪中,设置反应程序:(热盖关)37℃,30min;4℃,hold,进行RNaseH消化反应。 3.DNaseI消化 3.1将DNaseI消化试剂从-20°C取出,解冻后颠倒混匀,置于冰上备用。按照表4所示,配制DNaseI消化反应体系。 表4DNaseI消化反应体系 名称体积(μL) DNaseIBuffer27.5 DNaseI2.5 上一步产物20 Total50 3.2使用移液器轻轻吹打混匀,瞬离将反应液离心至管底。 3.3将上述PCR管置于PCR仪中,设置反应程序:(热盖关)37℃,30min;4℃,hold,进行DNaseI消化反应。 4.RNA纯化 4.1准备工作:将HieffNGS®RNACleaner(Cat#12602)磁珠由冰箱中取出,室温平衡至少30min。用NucleasefreeH2O 配制80%乙醇。 4.2涡旋振荡或充分颠倒磁珠以保证充分混匀。 4.3吸取110μLHieffNGS®RNACleaner(2.2×,Beads:DNA=2.2:1)至上一步产物中,移液器充分吹打混匀,室温孵育5min。 4.4将PCR管置于磁力架中分离磁珠和液体,待溶液澄清后(约3min),小心移除上清。 4.5保持PCR管始终置于磁力架中,加入200μLNucleasefreeH2O新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30sec后, 小心移除上清。 4.6重复步骤4.5,总计漂洗两次。用10μL移液器吸干净残留液体。YeasenBiotechnology(Shanghai)Co.,Ltd. Hotline:400-6111-883 E-mail:order@yeasen.com 网址:www.yeasen.com第3页,共4页 4.7保持PCR管始终置于磁力架中,室温下开盖干燥磁珠(5~10min)。 4.8RNA洗脱:将PCR管从磁力架上取下,加入11μLNucleasefreeH2O(或使用适合下游实验的相应体积NucleasefreeH2O 或洗脱缓冲液),使用移液器轻轻吹打至充分混匀,室温静置5min。 4.9将PCR管短暂离心并置于磁力架中静置,待溶液澄清后(约3min),小心移取10μL上清(可根据步骤4.8选择的实 际洗脱体积进行相应调整)至新的NucleasefreePCR管中。 【注】洗脱后的样品请立即进行下游实验,或置于-80℃存放。YeasenBiotechnology(Shanghai)Co.,Ltd. Hotline:400-6111-883 E-mail:order@yeasen.com 网址:www.yeasen.com第4页,共4页 备忘录: ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ———————————————————————————————————————— ————————————————————————————————————————

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